Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCTD13Q8WZ19 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms