Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
LINC00612Q8N6U2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms