Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC141Q6ZP82 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC141Q6ZP82 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms