Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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SAMD13Q5VXD3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SAMD13Q5VXD3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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