Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GREB1Q4ZG55 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms