Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMC1AQ14683 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMC1AQ14683 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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