Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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FOXE3Q13461 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
FOXE3Q13461 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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