Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms