Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CHRNEQ04844 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms