Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
POLR2FP61218 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms