Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NESP48681 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NESP48681 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NESP48681 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NESP48681 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms