Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ARCN1P48444 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms