Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PBX2P40425 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PBX2P40425 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms