Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2E1P29083 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms