Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPRGP23470 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPRGP23470 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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