Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPRDP23468 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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