Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PCNAP12004 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PCNAP12004 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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