Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGA3P0DJD8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms