Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LRRTM2O43300 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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