Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGSM2O43147 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGSM2O43147 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms