Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms