Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
U3KQV3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
U3KQV3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
U3KQV3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
U3KQV3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQV3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQV3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQV3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQV3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQV3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQV3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQV3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQV3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
U3KQV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQV3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms