Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDV3Q9UKY7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDV3Q9UKY7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDV3Q9UKY7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDV3Q9UKY7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDV3Q9UKY7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDV3Q9UKY7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms