Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FBXO3Q9UK99 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FBXO3Q9UK99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FBXO3Q9UK99 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms