Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF223Q9UK11 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ZNF223Q9UK11 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF223Q9UK11 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms