Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MSRAQ9UJ68 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MSRAQ9UJ68 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MSRAQ9UJ68 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms