Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CTNNAL1Q9UBT7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CTNNAL1Q9UBT7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms