Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYK1

TLR7, Toll-like receptor 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,049 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR7Q9NYK1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TLR7Q9NYK1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TLR7Q9NYK1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR7Q9NYK1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms