Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KLHL11Q9NVR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLHL11Q9NVR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLHL11Q9NVR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms