Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM30AQ9NV96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM30AQ9NV96 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms