Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.82■■■□□ 2.37
ATG3Q9NT62 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATG3Q9NT62 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ATG3Q9NT62 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms