Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CENPMQ9NSP4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CENPMQ9NSP4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CENPMQ9NSP4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms