Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PHPT1Q9NRX4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHPT1Q9NRX4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms