Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR9Q9NR96 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TLR9Q9NR96 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TLR9Q9NR96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms