Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LY9Q9HBG7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LY9Q9HBG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LY9Q9HBG7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms