Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP13A3Q9H7F0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATP13A3Q9H7F0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A3Q9H7F0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms