Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LRRN3Q9H3W5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRN3Q9H3W5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRN3Q9H3W5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms