Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF39Q9H2S5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF39Q9H2S5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
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