Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMG9Q9H0W8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMG9Q9H0W8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMG9Q9H0W8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
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