Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NYXQ9GZU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NYXQ9GZU5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NYXQ9GZU5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms