Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGIF2Q9GZN2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGIF2Q9GZN2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGIF2Q9GZN2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms