Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC39A8Q9C0K1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC39A8Q9C0K1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC39A8Q9C0K1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms