Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INO80BQ9C086 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INO80BQ9C086 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INO80BQ9C086 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms