Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM6Q9C030 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM6Q9C030 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM6Q9C030 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms