Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC4A9Q96Q91 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC4A9Q96Q91 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC4A9Q96Q91 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC4A9Q96Q91 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms