Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRNT1Q96Q11 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRNT1Q96Q11 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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