Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF558Q96NG5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF558Q96NG5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF558Q96NG5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms