Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
LRRIQ1Q96JM4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
LRRIQ1Q96JM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LRRIQ1Q96JM4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRRIQ1Q96JM4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
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