Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRIG1Q96JA1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRIG1Q96JA1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRIG1Q96JA1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms