Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HDAC2Q92769 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HDAC2Q92769 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HDAC2Q92769 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HDAC2Q92769 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms